工商時報 孫彬訓／台北報導
金控公司2003年開始運用連結稅制申報，直到今年初國稅局核定營 所稅，將營業費用及利息支出費用共計69億元剔除，影響所致，14家 金控的稅額和抵稅權，2003年就超過17億元，現進入復查階段，業者 已作好準備，「鐵定」會來到訴願、行政救濟乃至於打行政官司的最 壞準備。
金控公司指出，當初運用連結稅制，主要是內部有虧損的公司，因 經濟實質上屬同一個體，不用等到集團子公司日後產生課稅所得，方 能使用虧損扣抵，也就是可以「盈虧互抵」。
但後來實務上運作時發現，合併申報計算較為繁瑣，且立法當初， 為了租稅公平由金控選擇是否連結申報，現在反而成為雙方意見分歧 的爭訟。
癥結點在於國稅局認為，金控的投資收益為免稅收益，因此要求直 接歸屬投資收益的相關營業費用及利息支出，都要在報稅時剔除，這 也是因為所得稅法第42條規定，轉投資收益免稅，所以費用不能認列 ；但金控業者認為，金控的投資收益都是子公司已課稅後的所得，不 是免稅收益，所以費用可以認列。
由於金控本業是「投資與管理」旗下子公司，沒有其他本業，因此 課稅問題的嚴重性，才被凸顯出來。
現在金控公司透過金融總會與國稅局持續溝通。國稅局曾要求各金 控提供資金流程，看金控的費用中，各子公司要各分擔多少，國稅局 能讓金控認列多少，但金控方面主張，每家金控子公司架構不同，應 看個別金控的免稅比例來認列。
此外，近期多家金控提出增資計畫，也將面臨課稅的問題，因為當 子公司有資金需求時，多數是採增資方式，向金控母公司要求挹注資 本，並由金控母公司對外舉債支應。這部分，國稅局認為，作為免稅 投資使用，應該剔除，但金控主張，以集團觀點來看，資金是由子公 司應用，並非免稅投資。